秀姑巒溪泛舟遊客中心位於花東縱谷瑞穗大橋旁，是秀姑巒溪泛舟活動的起點，泛舟中心建築外觀仿自原住民傳統建築，中心前廣場還有一巨大的原住民圖騰，造型相當別緻；中心一、二樓展示區介紹秀姑巒溪泛舟河段的生態資源，影片播放室播放泛舟安全影片，泛舟中心並設有露營區，每逢泛舟季節，遊客如織。